Ponzo ha contribuito in modo determinante alla doppia promozione del Modena dalla Serie C1 alla Serie A e ha avuto l’opportunità di giocare in due stagioni di massima serie. Il suo esordio nella Serie A è avvenuto il 11 settembre 2002, in un match che ha visto il Modena affrontare il Milan, nonostante la sconfitta della sua squadra in quella occasione. Dopo la retrocessione del Modena al termine della stagione 2003-2004, Ponzo è rimasto fedele al club gialloblù per un’altra stagione.

Tra il 2005 e il 2012, ha continuato a dare il suo contributo al calcio professionistico indossando le maglie di squadre come lo Spezia, la Reggiana, il Savoia e l’Imperia. Nel 2012, ha deciso di porre fine alla sua carriera da calciatore. 

Dopo il ritiro dal calcio giocato, ha intrapreso una carriera nel settore dirigenziale e si è unito al Savona come responsabile del settore giovanile. Purtroppo, il 24 marzo 2013, all’età di 41 anni, Paolo Ponzo è tragicamente scomparso all’ospedale Santa Corona di Pietra Ligure. La sua prematura morte è stata causata da un malore che ha avuto durante una corsa podistica a Loano, e tra le cause del malore è stato segnalato un attacco di assideramento, che ha colpito l’ex atleta.